EM菌是水产养殖中的常用菌之一，能够稳定和改善水质，促进鱼虾蟹的生长，减少病原微生物和不良藻类。EM菌具有净水、稳水和肥水的作用，属于复合菌种，包括芽孢菌、酵母菌、光合菌、乳酸菌、放线菌等多种有益微生物。
EM菌在发酵过程中，除了菌种之外，还有添加水、红糖等培养物，密闭发酵才能得到EM菌发酵菌液。发酵成功后的菌液呈棕褐色，有强烈的酸味及酸臭味，PH值在3~5之间，一般在25~35℃发酵24~48小时后即可成功得到发酵原液。
EM菌在发酵过程中会受到外界的因素比较大，特别是温度，所以发酵成功后的菌液，会获得不同的发酵效果。比如：有些发酵菌液能够产生大量的泡沫及气体，这是由于EM菌中的酵母菌在发酵过程中，大量的产气，甚至能将发酵容器鼓起。但有时EM菌在发酵过程中由于所用水或培养基不同，会使乳酸菌大量的生长和繁殖，所得到的菌种气体、泡沫较少，但是能够产生大量的酸臭味道。所以，EM菌在发酵成功之后所产生的泡沫、气体及味道并不能代表EM菌发酵成功与否的标准。
EM菌发酵成功与否，最好是检测PH值；有条件的可以对EM菌进行镜检，观测其菌液中所包含的菌种的种类、形态和数量。但在显微镜下看到的菌种种类，与发酵过程中EM菌中某种菌种大量的繁殖有关，所以镜检结果不同；如酵母菌大量生长繁殖镜检下则多是酵母菌，如乳酸菌大量生长繁殖时则镜检下多是乳酸菌；发酵最成功的菌种镜检则是多种菌并存。
EM菌发酵失败最主要的原因是温度过低，特别是在秋冬季或早春发酵时，由于温度较低，发酵的时间不够，会使发酵的效果受到极大的影响；毕竟EM菌属于活菌种，水质要求对它影响也比较大，当所用自来水中所含有的余氯较多时，就非常影响EM菌的发酵，如果使用被污染过的池塘水，池塘水中的杂菌也会在发酵过程中成为优势群体，导致发酵失败。
EM菌发酵必须要密闭，密闭的越严实，其发酵的效果越好；在发酵过程中，发酵器皿中要留有一定量的空间，以保证发酵成功。
撰稿：王老师
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